1999年(平成11年)度に行われた、街区高度利用土地区画整理事業や安全市街地形成土地区画整理事業、緑住区画整理事業などの統廃合によって創設されたのが、「都市再生区画整理事業」である。他の区画整理事業が、未整備の土地を実際に整備することを主目的としているのに対して、都市再生区画整理事業は、一般会計からの「区画整理補助制度」である点が大きな違いである。具体的には、土地区画整理事業の事業費への補助や、公共施設充当用地取得費への補助などが行われる。