債務者（ローンを借りた人）の返済が遅れる場合などに備える保険（債務保証特定保険）を住宅金融支援機構が銀行に対して引き受けるという仕組みをとる。また、銀行などがフラット35「保証型」を担保として発行する債券などについて、債務の支払保証も行う。借入条件は買取型とほぼ同じだが、買取型が価格の90％までを融資可能額とするのに対し、保証型は100％まで融資可能な点などが異なる（保証型でも90％以内とする金融機関もある）。

フラット35（S）の詳細はコチラ